Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA3P25788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms