Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCEA1P23193 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCEA1P23193 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCEA1P23193 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms