Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BGNP21810 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BGNP21810 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BGNP21810 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BGNP21810 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BGNP21810 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BGNP21810 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BGNP21810 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BGNP21810 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BGNP21810 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BGNP21810 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BGNP21810 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BGNP21810 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BGNP21810 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BGNP21810 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BGNP21810 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BGNP21810 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BGNP21810 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BGNP21810 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BGNP21810 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BGNP21810 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BGNP21810 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BGNP21810 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BGNP21810 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BGNP21810 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BGNP21810 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BGNP21810 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BGNP21810 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BGNP21810 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BGNP21810 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BGNP21810 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BGNP21810 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BGNP21810 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms