Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP3P21580 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP3P21580 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms