Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB4AP20338 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms