Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE6AP16499 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE6AP16499 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6AP16499 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6AP16499 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms