Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TIMP2P16035 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMP2P16035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP2P16035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMP2P16035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMP2P16035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms