Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF2P15336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF2P15336 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF2P15336 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF2P15336 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF2P15336 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF2P15336 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF2P15336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF2P15336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF2P15336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF2P15336 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF2P15336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF2P15336 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF2P15336 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF2P15336 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF2P15336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF2P15336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF2P15336 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF2P15336 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF2P15336 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF2P15336 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF2P15336 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATF2P15336 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF2P15336 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF2P15336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF2P15336 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF2P15336 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF2P15336 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF2P15336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF2P15336 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF2P15336 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF2P15336 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF2P15336 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF2P15336 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF2P15336 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF2P15336 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms