Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAM1P13591 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAM1P13591 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAM1P13591 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms