Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFD1P11586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTHFD1P11586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.6 ms