Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP10827 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP10827 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP10827 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP10827 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP10827 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP10827 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP10827 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRAP10827 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRAP10827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THRAP10827 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP10827 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP10827 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRAP10827 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms