Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMIGD3P0DMS9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms