Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPBGLP0DKB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGLP0DKB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms