Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSPAN13O95857 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPAN13O95857 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms