Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN9O95484 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN9O95484 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms