Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5LO95447 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms