Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPO95166 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPO95166 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms