Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A2O94788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH1A2O94788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms