Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD17O75943 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD17O75943 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD17O75943 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD17O75943 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD17O75943 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD17O75943 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD17O75943 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD17O75943 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD17O75943 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD17O75943 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD17O75943 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD17O75943 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD17O75943 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD17O75943 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD17O75943 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD17O75943 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD17O75943 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD17O75943 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD17O75943 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD17O75943 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD17O75943 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD17O75943 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD17O75943 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD17O75943 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD17O75943 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD17O75943 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD17O75943 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD17O75943 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD17O75943 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD17O75943 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD17O75943 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD17O75943 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD17O75943 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD17O75943 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD17O75943 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD17O75943 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD17O75943 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD17O75943 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD17O75943 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD17O75943 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD17O75943 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD17O75943 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD17O75943 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD17O75943 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD17O75943 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD17O75943 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD17O75943 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD17O75943 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD17O75943 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD17O75943 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD17O75943 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD17O75943 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD17O75943 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms