Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3O75679 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3O75679 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms