Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF1CO43896 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms