Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR2O43760 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms