Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC3O43617 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3O43617 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms