Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF14O43557 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms