Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFSF12O43508 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF12O43508 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFSF12O43508 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms