Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ1O43426 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SYNJ1O43426 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SYNJ1O43426 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
SYNJ1O43426 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ1O43426 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ1O43426 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ1O43426 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms