Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTIFO43310 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTIFO43310 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTIFO43310 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTIFO43310 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTIFO43310 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTIFO43310 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTIFO43310 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTIFO43310 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTIFO43310 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTIFO43310 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTIFO43310 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTIFO43310 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTIFO43310 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTIFO43310 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTIFO43310 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTIFO43310 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTIFO43310 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTIFO43310 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTIFO43310 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTIFO43310 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTIFO43310 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTIFO43310 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTIFO43310 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTIFO43310 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTIFO43310 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTIFO43310 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTIFO43310 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTIFO43310 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CTIFO43310 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTIFO43310 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTIFO43310 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTIFO43310 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTIFO43310 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTIFO43310 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTIFO43310 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTIFO43310 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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