Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRODHO43272 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRODHO43272 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRODHO43272 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRODHO43272 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRODHO43272 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRODHO43272 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRODHO43272 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRODHO43272 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRODHO43272 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRODHO43272 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRODHO43272 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRODHO43272 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRODHO43272 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRODHO43272 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRODHO43272 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms