Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD3O43242 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms