Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRXO43186 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRXO43186 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRXO43186 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRXO43186 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRXO43186 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRXO43186 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRXO43186 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRXO43186 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRXO43186 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRXO43186 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRXO43186 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRXO43186 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRXO43186 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRXO43186 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRXO43186 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRXO43186 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms