Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSC2O15499 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSC2O15499 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSC2O15499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSC2O15499 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSC2O15499 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSC2O15499 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSC2O15499 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSC2O15499 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSC2O15499 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSC2O15499 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSC2O15499 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSC2O15499 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSC2O15499 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSC2O15499 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSC2O15499 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSC2O15499 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSC2O15499 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSC2O15499 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSC2O15499 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSC2O15499 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSC2O15499 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSC2O15499 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSC2O15499 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSC2O15499 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms