Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTDSPLO15194 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPLO15194 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPLO15194 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms