Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1D1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1D1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1D1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1D1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H7C1D1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1D1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1D1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H7C1D1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1D1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1D1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1D1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
H7C1D1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1D1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1D1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1D1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1D1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H7C1D1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1D1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1D1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H7C1D1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
H7C1D1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
H7C1D1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H7C1D1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H7C1D1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H7C1D1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1D1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1D1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1D1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H7C1D1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1D1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1D1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1D1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H7C1D1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1D1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H7C1D1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
H7C1D1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H7C1D1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H7C1D1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H7C1D1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1D1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1D1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1D1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
H7C1D1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1D1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H7C1D1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
H7C1D1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms