Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L11C9JVI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP17L11C9JVI0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms