Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC169A6NNP5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC169A6NNP5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms