Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200CA6NKL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200CA6NKL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms