Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEMP2A6NFY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms