Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV27A0A087WT01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV27A0A087WT01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms