Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms