Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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