Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP31Q70CQ4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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