Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MTRF1L-208ENST00000464135 3651 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27.4
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PRPF8Q6P2Q9 CAP2-205ENST00000479291 1378 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.19e-10■■■■■ 27.3
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PRPF8Q6P2Q9 SUPT16H-205ENST00000556217 1027 ntTSL 213.69□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 SUPT16H-206ENST00000556309 582 ntTSL 30.24□□□□□ -2.377e-8■■■■■ 27.3
PRPF8Q6P2Q9 WDR90-217ENST00000550593 544 ntTSL 415.71■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 27.3
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