Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms