Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms