Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC153Q494R4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms