Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PRR4Q16378 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms