Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms