Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRD3Q15059 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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