Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms