Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms